T15 CCM - Turma 15 do Curso de Ciências Moleculares

Blog no Google

Hum, nosso blog ainda não está no google, mas acho que isto se deve a falta de links em outras páginas se referindo a nosso blog. Se alguém tiver uma página, coloque o link pro blog!
No entanto, nosso blog aparece sim no google blog search, bastando procurar "t15 ccm" que já se encontra o blog!
Se se procura por ciências moleculares aparece o post do cabeçalho de EPs... aparentemente nenhum outro post contém a string ciências moleculares...ops!

Helena Keller

Lembram daquele larva que foi uma sexta no CM.
Esses dias o pessoal tava comentando os planos dele, revelados pelo orkut, em que ele revela-va na superação de Helena Keller...
Para quem se interessar, e tiver sem sono, vai passar um filme sobre ela hoje O Milagre de Anne Sullivan SBT, 2h40 (da madruga), que conta a história da mesma!

Não que eu vá assistir, mas fica o recado!

Discussão orkut

Já postei isso na comunidade do CM no orkut, mas vou postar aqui também, caso alguém queira ver.
Na comunidade de física rolou uma pequena discussão, que acabou envolvendo o CCM. Tudo começou com uma menina perguntando qual o melhor curso de física.
É legal pois mostra duas visões distintas sobre o curso.
(No final ela caiu um pouco pro lado pessoal)
Fica ai o link para caso alguém queira comentar aqui ou lá.
http://www.orkut.com/CommMsgs.aspx?cmm=74694&tid=2428090427146482277&start=1link

Nada muito importante...

1 - Acho que agente deveria fazer um Churras !!!!!!!!!! O Que vcs acham?????
Se toparem, quando e aonde agente faz??????????? Opinem...

2- Seria legal saber os aniversarios de tdos, para nunca passarem em branco.

Semana

Vou tentar colocar toda semana uma agenda da propria
Me ajudem a colocar tudo

1) Prova do Mané para segunda(31/10) ate o comeco da aula dele (14h00).
2) Lab do Bechara (decapitacao de ratinhos) se eu nao me engano quarta(02/11)as 08h00 - LEMBREM DO AVENTAL.
3) Leitura da xerox do Toresi, pois a aula dele vai ser baseada em um debate sobre esses textos - disponivel na pasta.
4) Escutei rumores que havera lab do Torresi...
5) Ep do Alair.
6) Quem ainda nao entregou os relatorios do bechara, nao desistam, ainda da para entregar.
7) Tem as questoes da Alinka para entregar.

EP4

O Alair ficou de mandar o EP4 para o Panda, e até o momento não mandou. Mas está disponível para xerox na pasta. Trata-se de um programa para esconder mensagens em imagens(e obviamente recuperá-las também), é sobre esteganografia, e parece ser bem interessante.
A propósito, estou lembrando a todos que não entregaram o EP3 ainda, que entreguem logo, não sei se o Alair vai aceitar e até quando, mas ele mencionou que o peso da nota dos EPs é crescente, ou seja, o EP3 vale mais que o EP2.

Ah, e eu troquei as colunas do blog, por nenhum motivo, só por trocar, alguém achou melhor ou pior assim??? Não precisa justificar, é só falar gostei/não gostei.

E alguém tem alguma imagem de fundo discreta porém legal, e que tenha algo a ver com o curso ou com a gente, para que possamos trocar esta?

Prova do Mané - Parte I

Calcular:
a) Integral[x*sen[x²+1]dx] (Integral indefinida)
b) Integral[sen³[x]cos³[x]dx, 0 a Pi]
c) Integral[x*sqrt[x²+1]dx, 0 a 1]

Para facilitar a notacao vamos adotar:
Integral[f(x)dx, de a a b] = $[a,b]f(x)dx

a) Trivial: (substituicao u=x²+1)
$x*sen[x²+1]dx = (subst u=x²+1 du=2xdx) $sen[u]du/2 = -cos[u]/2 = -cos[x²+1]/2

b) $[0,Pi]sen³[x]cos³[x]dx = $[0,Pi](sen[x]cos[x])³dx = $[0,Pi](sen[2x]/2)³dx = (subst u=2x du=2dx) $[0,Pi](sen[u]/2)³2dx = $[0,Pi]sen³[u]dx/4 = $[0,Pi]sen²[u]*sen[x]dx/4 = $[0,Pi](1-cos²[x])sen[u]dx/4 = (subst t=cos[u] dt=-sen[u]dx) -$[0,Pi](1-t²)dt/4 = -$[0,Pi]dt/4 + $[0,Pi]t²dt/4 = -t/4 + t³/12 |x=[0,Pi] = -cos[2x]/4 + cos³[2x]/12 |x=[0,Pi] = -cos[2Pi]/4 + cos³[2Pi]/12 +cos[0]/4 - cos³[0]/12 = -1/4 + 1/12 + 1/4 - 1/12 = 0

c) $x*sqrt[x+1]dx = (subst u=x+1 du=dx) $[0,1](u-1)sqrt[u]du = $[0,1]u*sqrt[u]du - $[0,1]sqrt[u]du = $[0,1]u^(3/2)du - $[0,1]u^(1/2)du = 2u^(5/2)/5 - 2u^(3/2)/3 |x=[1,0] = 2u^(5/2)/5 - 2u^(3/2)/3 |x=[1,0] = 2(x+1)^(5/2)/5 - 2(x+1)^(3/2)/3 |x=[1,0] = 2(2)^(5/2)/5 - 2(2)^(3/2)/3 - ( 2/5 - 2/3) = 8 sqrt[2]/5 - 4 sqrt[2]/3 - 2/5 + 2/3 = 4 sqrt[2]/15 + 4/15 = 4 (1+sqrt[2])/15


4.15: 9: f é contínua e derivável duas vezes num intervalo aberto (a,b), a reta unindo os pontos (a,f(a)) e (b,f(b)) intercepta f em (c,f(c)), a < c < b. Mostre que existe t tal que f''(t)=0

Dem.: f é contínua e derivável no intervalo, aplicando o TVM nos intervalos [a,c] e [c,b], temos que existem k1 e k2, tais que f'(k1)=(f(c)-f(a))/(b-a) e f'(k2)=(f(b)-f(c))/(b-c) mas f(a),f(b) e f(c) são colineares(fazem parte do segmento (a,f(a)), (b,f(b))), e logo f'(k1)=(f(c)-f(a))/(b-a)=(f(b)-f(c))/(b-c)=f'(k2).
Pelo teorema de Rolle, f'(k1)=f'(k2) => Existe t tal que f''(t)=0.


4.15: 10:
a) Mostre que g assume todos os valores entre f'(a) e g(b) no intervalo (a,b). Use o teorema do valor médio para mostrar que f' assume todos os valores entre f'(a) e g(b).

g(x) = (f(x)-f(a))/(x-a) se x!=a

= f'(a) se x=a

b) a mesma coisa mas com x=b

Dem.:
a) A funcao g dá o coeficiente angular da secante entre (a,f(a)) e (x,f(x))

f(x) é contínua, f(x)-f(a) é contínua e (f(x)-f(a))/(x-a) é contínua se x!=a, logo, g(x) é contínua para x!=a
g(x) é contínua em a, pois lim x->a+ g(x)=lim x->a+ (f(x)-f(a))/(x-a)=f'(a)=g(a) (pela def de derivada)
assim, g é contínua em (a,b), e pelo teorema do valor intermediário, se g(a)<y<g(b) existe x tal que g(x)=y, de modo que todo valor entre g(a)=f'(a) e g(b) serão percorridos.

b)Análogo.

Prova do Mané

Sombra, a prova do Mané é pra ser entregue 2a feira e consiste basicamente de exercícios do Apostol:

4.15: 7,9,10
4.19: 8
4.21: 11,17,25,27
5.5: 21,23,27
5.8: 22,23
5.10: 20,21
5.11: 5

Calcular:
a) Integral[x*sen[x²+1]dx] (Integral indefinida)
b) Integral[sen³[x]cos³[x]dx, 0 a Pi]
c) Integral[x*sqrt[x²+1]dx, 0 a 1]

Esta eh a prova, vamos postando as respostas conforme forem resolvidas.
A prova pode ser feita ateh em trio.

Jogos

Outra coisa... alguem tem joguinhos de comptador? Mesmo que nao tenha, pelo menos gosta? sabe onde baixar jogos descentes [pop's também]?? Deu uma vontade louca de jogar sim city... a proposito estou com enter the matrix, rise of nations, 007-nightfire, splinter cell e GTA San Andreas

Contatos MSN

Gente.. poe ai os contatos MSN de vcs....
às vezes precisamos falar com alguem e nao tem como...
o meu é bruno_barreira@hotmail.com

naippe

será que o pessoal do naippe cansou da gente? acho que a gente vai virar mais um daqueles projetos do estado abandonados por falta de verba já que ninguém mais quer observar a gente.... por isso q já cortaram as bolsas.... ou vai ver eles só mudaram pra outro lugar pq tavam com medo que a gente descobrisse tudo... maldita tecnologia wireless.... agora eles podem ver nos observar a distância...

Seminários e Ratos

Pra quem não foi na aula do Bechara hoje, ele deu cadeia respiratória, e ficou falando de muitas coisas da mitocôndria (pelo menos na parte que eu estava acordado).
AVISOS:
1. Os seminários serão atrasados: cada dia de seminário passa para o seguinte, pois o Bechara quer terminar glicogênio antes dos seminários.
2. A aula que vem é laboratório, e vamos matar ratos na guilhotina, é terca-feira e começa às 8:00.

Por que o elétron não cai no núcleo???

Eu andei dando uma olhada sobre a questão e achei algumas respostas; não muito satisfatórias, e enfim, acho que só descobriremos quando fizermos quântica (ou talvez não).

Mas a acho que a idéia principal que encontrei é aquela mesma dos níveis discretos de energia... resolvendo a equação de Schrödinger, há níveis discretos de energia que os elétrons podem ocupar, e funções de probabilidades associadas aos tais níveis, de modo que o elétron pode estar nas posições da orbital correspondente a seu nível de energia e que não prevê passagens pelo núcleo.

Bom, acho que isso é uma enrolação, pois não explica porque o elétron mantém a energia constante, sendo que teria movimento acelerado(mudança de direção) e assim estaria emitindo energia.

Além do mais, aquela história de princípio da incerteza me pareceu ser mais enrolado ainda, e daí que no núcleo a incerteza da velocidade é grande? o que isso nos diz sobre a possibilidade e a probabilidade de encontrar o elétron lá?

E mais, eventualmente o elétron cai no núcleo sim! Eu achei algumas coisas falando sobre captura de elétrons, que ocorre em núcleos instáveis, ele captura o elétron da camada mais baixa, converteum próton em neutron emitindo um neutrino, e faz os elétrons de cima caírem um nível, emitindo um padrão de radiação. Então eventualmente o elétron cai? Sim, há forças fracas em jogo, mas isso não responde, por que então quando há mais forças o elétron pode cair?

Enfim, acho que é uma história muito mal explicada... quem sabe o Fleming tem uma resposta?

Vida artificial(de verdade)

Abriu-se uma competição para o primeiro grupo que conseguir criar um ser auto-replicante capaz de evoluir e metabolizar. Além da do Craig Venter lah do genoma, que quer achar uma célula com o genoma mínimo, tem um grupo apostando num projeto chamado Los Alamos Bug, tentando criar células de membranas de ácidos graxos e PNA(peptide nucleic acid), parece ser muito interessante e eles já tem alguns resultados, nada muito vivo, é verdade, mas parece ser bem promissor.
Alive! The race to create life from scratch - New Scientist

Só pra quem vai à aula

pessoal ai q vai a aula!!! por favor diz os capitulos do Campbell que caem na prova de bioquimica... [enzima, lipideo, carboidrato, membrana. Cai o q mais? dna?]... como foi a aula de exercicio?? vai cair as paradas da enzima [aqueles calculos com km, k num sei o q, grafico de fulano de tal]?? por favor.. alguem posta um coment descente... dizendo o que foi dado, o que nao foi... o q possivelmente vai ser cobrado... sei lah... diz um roteiro pra quem nao vai a aula estudar!!!!
Obrigaduuuu
ah.. alguem sabe quando acabam as aulas?

Prova Bioquímica

Matheus, eu dei uma olhada e acho que o que cai é isso:

Capítulo 6 - Enzimas 190-238
Capítulo 7 - Carbohidratos e Glicobiologia 239-272
Capítulo 10- Lipídios 343-368
Capítulo 11- Membranas 370-420
Capítulo 14- Glicólise, Gliconeogênese e a via da
pentose fosfato 522-559
Capítulo 16- O cliclo do ácido cítrico 602-623
(acho que o ciclo de glioxilato não cai)

Total: 49 + 34 + 26 + 51 + 38 + 22 = 220 !!!


Ou seja, se vc ler 1 página por minuto(muito otimista), vai levar 3h 40min para ler tudo!
Dada a situação, recomendo que sejamos práticos e decoremos o ciclo de Krebs, a cadeia glicolítica e da gliconeogênese e completemos com o que der, baseando no que ele deu em aula.

Bioquimica

Alguém sabe no lenhinguer quais são os capítulos que caem ?

Eu tb acho que a prova de quimica não condiz com a matéria dada. Passar a transparência com o assunto não é dar aula.

Falow

Química

Eu estava dando uma olhada na matéria de química que eu não sabia na prova(ie a parte de orbitais moleculares) e vi que é muita coisa, eu duvido que o Torresi tenha dado a matéria toda na única aula que eu faltei, acho que deveríamos reclamar da prova e já que é um assunto importante pedir que ele explicasse melhor o tema.

Por falar em prova, quem já fez a questão 5?

Os compostos de C3H4 são H2C=C=CH2, HC=-C-CH3 e -H2C-CH=CH- (ciclo-propeno)?

Como encontrar os ângulos (especialmente o ciclo-propeno)?

E a hibridização?

Por que haveria ressonância?

Recorde!!!

Salve Moleculentos!
Hoje eu provei que o EP3 pode ser feito com complexidade n^3*q^5 !!!!!!!!!!!!!!!

Meu EP tá muito lerdo!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

coloquei pra rodar o xae e já está a mais de Duas Horas!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
absurdo!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


É isso ae!!

PS: Exagerei no uso de exclamações pra ver se nosso colega Rafael conclui seus estudos sobre as tendencias...aquele lá!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

EP3 - Entrega

Se alguém não ficou sabendo, o Alair reabriu o Panda e a data de entrega do EP3 é sexta-feira(hoje, dia 21). De modo que os que ainda não acabaram devem se apressar!

Eu não sei se é uma boa sugestão, mas recomendaria aos que "por algum motivo" não poderem entregar na data que mandem para o e-mail dele (alair@ime.usp.br) com alguma desculpa...

Fotos

As fotos da Luiza estão provisoriamente na minha conta:
http://www.cecm.usp.br/~rend/Fotos

Ops

Corrigindo meu ultimo post, pode-se sim criar um vetor com 10.000.000 posicoes, desde que ele seja declarado fora do main() (como variável global), o que elimina os problemas que mencionei, embora nem assim tenha funcionado no meu Windows.

Após exaustivos testes e correções(realizados no linux) acho que consegui os resultados "certos"(pelo menos são verossímeis):

Entre com a sequencia de DNA: ep3teste.txt
Qual o comprimento do q-fator? 2
Repeticoes nao triviais: 8
Quociente: 1.778

Entre com a sequencia de DNA: xae2.txt
Qual o comprimento do q-fator? 7
Repeticoes nao triviais: 766179758
Quociente: 2.922

Entre com a sequencia de DNA: xae.txt
Qual o comprimento do q-fator? 7
Repeticoes nao triviais: 4604541540
Quociente: 2.816

Comentem ou postem os seus para comparação.
A propósito, tive que usar um double para somar as repetições.
Para mostrar apenas 3 dígitos decimais usem "%.3lf" para não mostrar as casas decimais usem "%.lf"

Teste EP

Ei pizza,eu usei um switch para converter caracter e numero, ele comentou algo sobre isso na sala:

switch(DNA[i]) //le a letra
{
case 'A':l=0;break;
case 'C':l=1;break;
case 'G':l=2;break;
case 'T':l=3;
}

Como todos perceberam ou vão perceber, no windows e usando o dev-c++ não é possível declarar um vetor de tamanho 10.000.000, e nem mesmo 5.175.554, que é o tamanho do teste do xae.txt. Ou melhor, o programa compila mas não roda.
Eu uso Windows XP e no meu eu consegui declarar um vetor com tamanho máximo de 2077744 e o programa rodou normalmente.

Eu trunquei o arquivo xae.txt, que ficou com 2MB em vez de 5MB, e que consegue ser rodado com um vetor de tamanho 2077744:
http://www.cecm.usp.br/~rend/xae2.txt

Os resultados que eu obtive com os testes foram:

Sequencia de DNA: ACTGACTACA
q: 2
Repeticoes nao triviais: 8
Quociente: 1.77

Sequencia de DNA: xae2.txt
q: 7
Repeticoes nao triviais: 72886638
Quociente: 2069.497

Não sei se o último está certo, gostaria que vcs rodassem para compararmos.

Sobre o ep

ele é pra segunda até a meia noite ou até o final do domingo?

como leio uma String?

como faço para associar um número a cada caractere lido, por exemplo, A-0, C-1?

agradeço de antemão a bondade de quem possa ter a paciência de responder.

Seminários Bioquímica

Devido à proximidade dos seminários, resolvi repostar os temas para lembrar o pessoal:

- Os seminários de bioquímica serão nos dias 1,8 e 9 de novembro, em 3 seminários por dia e feitos em duplas.

- Além do seminário, cada dupla deve preparar também um texto de até 5 páginas(espaço simples e tamanho 12) e uma apresentação powerpoint(ou levar transparências que possam ser entregues).

- Os seminários durarão 45 minutos e terão 15 minutos adicionais para discussão.

Cada seminário deve abranger:
- conceito e contextualizaćão
- estrutura tridimensional
- propriedades fisico-químicas
- propriedades biológicas(relacões estrutura-função)
- implicações biomédicas

Os temas em ordem cronológica:

Dia 1:
- Contração Muscular
Daniel e Cabelo(Fernando Meirelles)

- Cinesinas
Pizza(Fernando Rossine) e Daizo

- Príons
Renan e Sombra(Bruno)

Dia 8:
- Ferritina
Luiza e Gustavo

- NO sintases
Matheus e Edison

- Ubiquitina
Rafael e Leo

Dia 9:
- ATP sintase
Carlos e Saulo

- Canais iônicos
Felipe e Luis

- Receptores de odores
Fena(Renato) Boo(Alexandre) e Layra

Os que mudarem de dupla, tema, etc, comentem para avisar.

Materia da prova

Fala galera!

Acho que seria interessante (principalmente pra mim... hehehe) se nos postassemos aqui a materia das provas... um bom comeco seria a materia da prova do bechara e do torresi...

Intuam felipe qto ao seu ep, vc tah dando espaco qdo vc digita as letras da sequencia, pq o espaco tb eh um caracter... Se vc quiser eu dou uma olhada no seu codigo pra tentar achar o problema..

Blog

ÊÊÊÊÊ!!! Finalmente, o saulo cadastrou no blog heheheh, isto é, todos estão cadastrados e o blog é propriamente da T15. Convito a todos que quiserem ajudar a personalizar e alterar o template do blog que me avisem para que os autorize como administradores.

Se alguém quiser sugerir algo mas achar que é preguicoso demais para fazer, pode falar também....

Ah, e hoje é aniversário do Luis, aeee!!! Parabéns Luis!

Salve Moleculentos!!!
Depois da bronca do Leo achei melhor postar algo!!(Brincadeira)
O fato é que nesse maravilhoso feriado estava eu fazendo meu EP 3 quando encontrei um problema e fiquei curioso.
Se eu coloco para entrar uma sequencia de n letras na minha sequencia, ele só armazena a metade...então estou tendo de multiplicar tudo por dois...
Achei estranho.
Existe uma explicação ou é problema exclusivo meu?

Blog

Tomei a liberdade de tomar emprestado o logotipo da página do ccm, não ficou lá tão bom assim, mas é o que temos no momento.

Pessoas, frequentem o blog, postem, dêem sugestões, o blog é de todos. Exceto pelo Saulo, toda a turma está cadastrada, mas poucos postam e comentam, para demonstrar olha só as estatísticas:

posts: Leo(8), Rafael(3), Matheus(2), Daizo(2), Luiza, Ogro, Felipe, Gustavo e Fena.

comentários: Felipe(7), Leo(6), Pizza(2), Matheus(2), Ogro(2), Bruno(2), Renan, Fena, Daniel e Daizo.

Não estou cobrando, mas o blog só é útil se as pessoas o visitarem com freqüência e postarem.


Recado: Saiu o EP chocolate 4!
O problema é criar uma função que retorne o binomial(int n, int k) realizando apenas adições (da ordem de k*n adições)

Matéria Escura

Não sei se alguém se interessa (a propósito, quem achou interessante comente dizendo "eu achei!" ou algo menos estúpido, mas comente para mostrar interesse) mas saiu um artigo demonstrando que a relatividade geral é suficiente para explicar a velocidade da rotação das galáxias, de modo que não é necessária matéria escura para explicar este fenômeno.

General Relativity Resolves Galactic Rotation Without Exotic Dark Matter
Authors: F. I. Cooperstock, S. Tieu
26 Jul 2005
http://arxiv.org/abs/astro-ph/0507619

Acessando periódicos

Ei, alguém que seguiu o email do boo conseguiu acessar periódicos de casa ?
Eu faço, mas depois que eu coloco a configuração de proxy no firefox ele não conecta em mais nada.
alguem pode detalhar ?

Abraço

Aula Alinka

Se alguém não sabe, amanhã(sexta-feira), haverá aula da Alinka e do professor substituto, a partir das 8:00 da manhã, e palestra a tarde.